Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf1Q9D2H9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnaaf1Q9D2H9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnaaf1Q9D2H9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms