Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D1K7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D1K7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D1K7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D1K7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D1K7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D1K7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D1K7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D1K7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D1K7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D1K7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D1K7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D1K7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D1K7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D1K7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D1K7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms