Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88Q9D0N8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88Q9D0N8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms