Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chaf1bQ9D0N7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chaf1bQ9D0N7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chaf1bQ9D0N7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chaf1bQ9D0N7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
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