Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpsap1Q9D0M1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpsap1Q9D0M1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpsap1Q9D0M1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpsap1Q9D0M1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms