Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfc5Q9D0F6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfc5Q9D0F6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc5Q9D0F6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc5Q9D0F6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc5Q9D0F6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms