Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ribc1Q9D0B8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ribc1Q9D0B8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ribc1Q9D0B8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms