Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dnajc18Q9CZJ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajc18Q9CZJ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnajc18Q9CZJ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc18Q9CZJ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajc18Q9CZJ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms