Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bud23Q9CY21 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bud23Q9CY21 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bud23Q9CY21 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms