Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp23Q9CX11 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp23Q9CX11 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp23Q9CX11 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms