Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ykt6Q9CQW1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ykt6Q9CQW1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ykt6Q9CQW1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.7 ms