Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole4Q9CQ36 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole4Q9CQ36 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pole4Q9CQ36 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms