Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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