Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe41Q99PV5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe41Q99PV5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhe41Q99PV5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms