Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird2Q99NI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2ird2Q99NI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms