Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b1Q99NB9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3b1Q99NB9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b1Q99NB9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms