Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkd1Q99MH6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkd1Q99MH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkd1Q99MH6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkd1Q99MH6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkd1Q99MH6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkd1Q99MH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkd1Q99MH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkd1Q99MH6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkd1Q99MH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkd1Q99MH6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms