Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp1b1Q99LU0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp1b1Q99LU0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp1b1Q99LU0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b1Q99LU0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms