Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cmtm3Q99LJ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cmtm3Q99LJ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cmtm3Q99LJ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms