Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcf19Q99KJ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcf19Q99KJ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcf19Q99KJ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf19Q99KJ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf19Q99KJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf19Q99KJ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms