Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ufsp2Q99K23 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufsp2Q99K23 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufsp2Q99K23 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms