Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TrabdQ99JY4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TrabdQ99JY4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrabdQ99JY4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.8 ms