Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlcd1Q99JT6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlcd1Q99JT6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tlcd1Q99JT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlcd1Q99JT6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlcd1Q99JT6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms