Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ophn1Q99J31 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ophn1Q99J31 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ophn1Q99J31 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ophn1Q99J31 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms