Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mcoln1Q99J21 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mcoln1Q99J21 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mcoln1Q99J21 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mcoln1Q99J21 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms