Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad3Q925I1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad3Q925I1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad3Q925I1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atad3Q925I1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms