Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42ep1Q91W92 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep1Q91W92 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep1Q91W92 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep1Q91W92 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep1Q91W92 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep1Q91W92 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep1Q91W92 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms