Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms