Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD76

Gtf2h3, General transcription factor IIH subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h3Q8VD76 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2h3Q8VD76 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf2h3Q8VD76 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2h3Q8VD76 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2h3Q8VD76 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms