Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2aQ8R0A6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2aQ8R0A6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2aQ8R0A6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm2aQ8R0A6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms