Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pof1bQ8K4L4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pof1bQ8K4L4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pof1bQ8K4L4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pof1bQ8K4L4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms