Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Casc3Q8K3W3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc3Q8K3W3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc3Q8K3W3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc3Q8K3W3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms