Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh16f2Q8K3M1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh16f2Q8K3M1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f2Q8K3M1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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