Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3H0

Appl1, DCC-interacting protein 13-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Appl1Q8K3H0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Appl1Q8K3H0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Appl1Q8K3H0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Appl1Q8K3H0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Appl1Q8K3H0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Appl1Q8K3H0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Appl1Q8K3H0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms