Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh3Q8K330 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh3Q8K330 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh3Q8K330 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssh3Q8K330 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh3Q8K330 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms