Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trip10Q8CJ53 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip10Q8CJ53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip10Q8CJ53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms