Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnka2ipQ8CH19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csnka2ipQ8CH19 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnka2ipQ8CH19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnka2ipQ8CH19 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnka2ipQ8CH19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms