Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr47Q8CGF6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr47Q8CGF6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr47Q8CGF6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms