Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ClasrpQ8CFC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ClasrpQ8CFC7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ClasrpQ8CFC7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClasrpQ8CFC7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms