Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc28bQ8CEG5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc28bQ8CEG5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28bQ8CEG5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28bQ8CEG5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28bQ8CEG5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28bQ8CEG5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28bQ8CEG5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc28bQ8CEG5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28bQ8CEG5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc28bQ8CEG5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28bQ8CEG5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms