Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb2Q8CC27 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb2Q8CC27 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacnb2Q8CC27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms