Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gpc5Q8CAL5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc5Q8CAL5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc5Q8CAL5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc5Q8CAL5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc5Q8CAL5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms