Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Spef2Q8C9J3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Spef2Q8C9J3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Spef2Q8C9J3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Spef2Q8C9J3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Spef2Q8C9J3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms