Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tsr2Q8C8T8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tsr2Q8C8T8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tsr2Q8C8T8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr2Q8C8T8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms