Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4bp3Q8C7U1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4bp3Q8C7U1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4bp3Q8C7U1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
N4bp3Q8C7U1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4bp3Q8C7U1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
N4bp3Q8C7U1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
N4bp3Q8C7U1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
N4bp3Q8C7U1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
N4bp3Q8C7U1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4bp3Q8C7U1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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