Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp5Q8BX09 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp5Q8BX09 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbbp5Q8BX09 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp5Q8BX09 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp5Q8BX09 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp5Q8BX09 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp5Q8BX09 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp5Q8BX09 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp5Q8BX09 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp5Q8BX09 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp5Q8BX09 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms