Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Catsper4Q8BVN3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Catsper4Q8BVN3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Catsper4Q8BVN3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Catsper4Q8BVN3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms