Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem260Q8BMD6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem260Q8BMD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem260Q8BMD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem260Q8BMD6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms