Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup93Q8BJ71 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup93Q8BJ71 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup93Q8BJ71 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup93Q8BJ71 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup93Q8BJ71 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup93Q8BJ71 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup93Q8BJ71 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup93Q8BJ71 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup93Q8BJ71 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup93Q8BJ71 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms