Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco3Q8BH01 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco3Q8BH01 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco3Q8BH01 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco3Q8BH01 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms